Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CltcQ68FD5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CltcQ68FD5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms