Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CilpQ66K08 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CilpQ66K08 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms