Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8eQ66JT1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc8eQ66JT1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms