Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim24Q64127 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms