Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pan3Q640Q5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms