Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Zfp248Q640N4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Zfp248Q640N4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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