Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc18Q640L5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc18Q640L5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
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