Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phc1Q64028 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phc1Q64028 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms