Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PatjQ63ZW7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PatjQ63ZW7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PatjQ63ZW7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PatjQ63ZW7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
PatjQ63ZW7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PatjQ63ZW7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PatjQ63ZW7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PatjQ63ZW7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PatjQ63ZW7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PatjQ63ZW7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PatjQ63ZW7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PatjQ63ZW7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PatjQ63ZW7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms