Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vil1Q62468 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vil1Q62468 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms