Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20865Q62460 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20865Q62460 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20865Q62460 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20865Q62460 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm20865Q62460 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm20865Q62460 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm20865Q62460 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm20865Q62460 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20865Q62460 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20865Q62460 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20865Q62460 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20865Q62460 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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