Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20809Q62458 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Gm20809Q62458 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm20809Q62458 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20809Q62458 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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