Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms