Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms