Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp1Q62442 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms