Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff3Q62395 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms