Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf6Q62311 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms