Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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