Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sprr1bQ62267 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms