Protein–RNA interactions for Protein: Q62252

Spa17, Sperm surface protein Sp17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spa17Q62252 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spa17Q62252 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spa17Q62252 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spa17Q62252 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms