Protein–RNA interactions for Protein: Q62247

Sox16, Protein SOX-16 (Fragment), mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox16Q62247 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sox16Q62247 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox16Q62247 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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