Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SspnQ62147 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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