Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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