Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Itga6Q61739 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms