Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd47Q61735 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms