Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms