Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne1Q61457 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms