Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vsx2Q61412 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsx2Q61412 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms