Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

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Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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Pde3bQ61409 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Pde3bQ61409 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Pde3bQ61409 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Pde3bQ61409 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Pde3bQ61409 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Pde3bQ61409 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Pde3bQ61409 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Pde3bQ61409 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Pde3bQ61409 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde3bQ61409 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Pde3bQ61409 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde3bQ61409 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms