Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd2Q61285 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd2Q61285 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms