Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Irf9Q61179 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf9Q61179 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms