Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf3Q60980 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf3Q60980 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms