Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbbp7Q60973 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms