Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HellsQ60848 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HellsQ60848 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HellsQ60848 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms