Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf8Q60846 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms