Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelnQ60841 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelnQ60841 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelnQ60841 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelnQ60841 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RelnQ60841 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelnQ60841 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelnQ60841 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelnQ60841 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelnQ60841 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelnQ60841 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RelnQ60841 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelnQ60841 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelnQ60841 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelnQ60841 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms