Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms