Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epha1Q60750 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms