Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxd4Q60688 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxd4Q60688 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms