Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CttnQ60598 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CttnQ60598 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms