Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp13a3Q5XF89 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms