Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms