Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scaf1Q5U4C3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms