Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc125Q5U465 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc125Q5U465 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc125Q5U465 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc125Q5U465 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc125Q5U465 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc125Q5U465 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc125Q5U465 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc125Q5U465 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms