Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myh1Q5SX40 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh1Q5SX40 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms