Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med13Q5SWW4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms