Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r196Q5SVD5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms