Protein–RNA interactions for Protein: Q5SU73

Coil, Coilin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoilQ5SU73 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CoilQ5SU73 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoilQ5SU73 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms