Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam71bQ5STT6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fam71bQ5STT6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms