Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Utp18Q5SSI6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms